Virusinfektioner hos hästar har betydande inverkan på djurvälfärd och kan leda till stora ekonomiska förluster. Ett av de första tecknen på en virusinfektion är utvecklingen av feber och att i detta tidiga stadium kunna identifiera orsaken bakom infektionen skulle leda till snabb och korrekt behandling samt möjliggöra implementering av lämpliga biosäkerhetsåtgärder för att stoppa ytterligare spridning. Men feber och andra kliniska symptom på viral infektion, t.ex. neurologiska störningar, förblir ofta odiagnostiserade. Därför kommer vi i denna studie använda metagenomik för att undersöka den virala orsaken bakom feberfall hos svenska hästar samt bakom neurologiska störningar hos hästar från Sverige och från de andra nordiska länderna. Denna metod gör det möjligt för oss att identifiera alla virus som finns i ett kliniskt prov. Därmed hoppas vi att kunskapen från detta projekt kommer bidra till att förbättra hästhälsan och kontrollera spridningen av dessa virusinfektioner.